Die Expo.02 entstand im Auftrag der Eidgenossenschaft. Realisiert wurde sie mit der Unterstützung des Volkswirtschaftsdepartements.

Organisiert war die Expo.02 als Verein, der „Verein Landesausstellung“, in welchem der Bund, die fünf Expo.02-Kantone (Bern, Freiburg, Jura, Neuenburg und Waadt) sowie die vier Standortgemeinden (Biel, Murten, Neuchâtel und Yverdon-les-Bains) vertreten waren.

Die Führung der Expo.02 setzte sich zusammen aus der Assemblée Générale (Generalversammlung), dem Comité Directeur (Steuerungskomitee) und der Direction Générale (Generaldirektion).

Die strategischen Funktionen wurden konzentriert am Sitz der Expo.02 in Neuchâtel wahrgenommen.